我国农业综合开发主体是政府。国家最高管理部门为国家农业综合开发办公室。全国各省、地、县都设有农业综合开发机构，但归属不—，农业综合开发机构有的设在财政部门，有的直属地方政府等， 形式多样。国家农业综合开发办公室成立以来，不断开拓，不断完善，把农业综合开发工作推向了制度化、规范化、科学化的轨道，制定下达的政策、规定、办法、标准和中国农业综合开发的“九五”计划纲要， 为我国农业综合开发的持续、高效发展奠定了基础，明确了方向。
一、农业综合开发的基本原则
1．内涵开发的原则。指坚持以内涵开发为主，外延开发为辅．也就是以改造中低产田为主，适量开垦宜农荒地。
2．突出重点的原则。指坚持对水土资源丰富、投入产出比较效益高，地方财政配套资金能力强、农民群众自觉投资投劳、各级党政领导重视支持，对国家贡献大的项目或地区优先开发、开发一片，见效一片。
3．持续发展的原则。指坚持开发利用农业资源与保护节约农业资源并举，优化生产要素组合，保护农业生态环境，促进农业资源持续利用，将农林牧副渔各业生产引向可持续发展的轨道。
4．因地制宜的原则。指坚持在农业资源开发利用上，从各地实际情况出发，发展粮棉油肉糖等农产品的生产，在改善生产条件上，充分利用现有农田不利基础设施，进行配套、修复和完善，缺什么、补什么。
5.先易后难的原则：指各地区农业综合开发任务繁重．必须按区域统一规划，合理布局，本着先易后难的原则，逐年安排，分步实施，集中连片开发，力求规模效益；
6．产业化经营的原则。指坚持实行农业产业化经营，以市场为寻向．立足当地资源优势，开发建设一批有市场、有资源，能带动农民群众牧快增加收入的项目，加快农村经济向商品化、产业比、现代化转变。
7．先验收后立项的原则。指对已竣工的农业综合开发项目工程，要严格检查验收，验收合格后，再确立新项目，
8效益第一的原则。指在农业综合开发项目工程建设中，要遵循价值规律，以市场为导向，以综合效益为中心，在大力发展粮棉油肉糖等农产品生产的基础上，抓好区域化、专业化．高效益的农业生产
9. 民办公助的原则。指坚持自力更尘为主． 国家扶持为辅的原则、 农业综合开发所需投资是通过多渠道、多层次、多方位筹集的，按照现行政策，农业综合开发资金由财政资金、银行专项贷款，农村集体和农民群众自筹资金和其他资金组成。为此，在农业综合开发所需资金筹措上，要以国家资金投入为导向，以农村集体和群众自筹资金为主体，调动社会各界参与农业综合开发投资的积极性。
10．配套落实的原则。指坚持工程措施、生物措施和科技措施配套落实，进行山水林田路综合治理，以达到高起点、高标准、高质量和高效益。
11．规模经营的原则。指在农业综合开发项目区内新开垦的辨地和新建果园、林场、牧场等，要适当集中，进行适度规模经胃，提高机械化作业水平，以实现农业综合开发的规模效益。
12。有偿使用的原则。指在农业综合开发项目区内凡投入经营性的财政资金，原则上实行有偿使用，将到期回收的财政有偿资金，继续投入农业综合开发项目工程建设，到期收回的银行专项贷款，也要继续用于农业综合开发项目工程建设。
二、农业综合开发的主要政策
1．要切实保护农民的生产积极性，促进农林牧副渔各业生产的产品价格政策。
2．要搞好农用生产资料的生产和供应，加强价格管理，降低流通费用，使农民群众得到更多的实惠。
3．要调整国民收入分配格局，加大对农业的投入力度，保证各项投入及时足额到位。农业综合开发项目区投入增加后．常规农业各项投入不能减少，对此．各地必须严格执行。
4．要继续落实“八五”期间对农业综合开发实行的优惠政策，如新开垦的耕地5年内免征农业税，柴油、化肥、农药、农膜等农用生产资料给予优先安排的政策， “九五”期间要继续保留。
5．要在农业综合范围内，实行谁开发、谁利用、谁受益，在一定时期内使用权不变，可以继承，可以依法有偿转让，，
6．要建立竞争机制实行奖优罚劣，投资不搞“基数”法。
7．要对改造中低产田和开垦宜农荒地增产的粮棉油糖等农产品，5年内不增加合同定购量。
8．要鼓励科技人员参加农业综合开发，对贡献突出的科技人员要给予奖励。
9．要视情况对农业综合开发专项贷款给于一定贴息。
10．要将国家立项的农业综合开发项目投资纳入国家固定资产投资计划，相应增加国家固定资产投资规模。
一、农业综合开发的基本原则
1．内涵开发的原则。指坚持以内涵开发为主，外延开发为辅．也就是以改造中低产田为主，适量开垦宜农荒地。
2．突出重点的原则。指坚持对水土资源丰富、投入产出比较效益高，地方财政配套资金能力强、农民群众自觉投资投劳、各级党政领导重视支持，对国家贡献大的项目或地区优先开发、开发一片，见效一片。
3．持续发展的原则。指坚持开发利用农业资源与保护节约农业资源并举，优化生产要素组合，保护农业生态环境，促进农业资源持续利用，将农林牧副渔各业生产引向可持续发展的轨道。
4．因地制宜的原则。指坚持在农业资源开发利用上，从各地实际情况出发，发展粮棉油肉糖等农产品的生产，在改善生产条件上，充分利用现有农田不利基础设施，进行配套、修复和完善，缺什么、补什么。
5.先易后难的原则：指各地区农业综合开发任务繁重．必须按区域统一规划，合理布局，本着先易后难的原则，逐年安排，分步实施，集中连片开发，力求规模效益；
6．产业化经营的原则。指坚持实行农业产业化经营，以市场为寻向．立足当地资源优势，开发建设一批有市场、有资源，能带动农民群众牧快增加收入的项目，加快农村经济向商品化、产业比、现代化转变。
7．先验收后立项的原则。指对已竣工的农业综合开发项目工程，要严格检查验收，验收合格后，再确立新项目，
8效益第一的原则。指在农业综合开发项目工程建设中，要遵循价值规律，以市场为导向，以综合效益为中心，在大力发展粮棉油肉糖等农产品生产的基础上，抓好区域化、专业化．高效益的农业生产
9. 民办公助的原则。指坚持自力更尘为主． 国家扶持为辅的原则、 农业综合开发所需投资是通过多渠道、多层次、多方位筹集的，按照现行政策，农业综合开发资金由财政资金、银行专项贷款，农村集体和农民群众自筹资金和其他资金组成。为此，在农业综合开发所需资金筹措上，要以国家资金投入为导向，以农村集体和群众自筹资金为主体，调动社会各界参与农业综合开发投资的积极性。
10．配套落实的原则。指坚持工程措施、生物措施和科技措施配套落实，进行山水林田路综合治理，以达到高起点、高标准、高质量和高效益。
11．规模经营的原则。指在农业综合开发项目区内新开垦的辨地和新建果园、林场、牧场等，要适当集中，进行适度规模经胃，提高机械化作业水平，以实现农业综合开发的规模效益。
12。有偿使用的原则。指在农业综合开发项目区内凡投入经营性的财政资金，原则上实行有偿使用，将到期回收的财政有偿资金，继续投入农业综合开发项目工程建设，到期收回的银行专项贷款，也要继续用于农业综合开发项目工程建设。
二、农业综合开发的主要政策
1．要切实保护农民的生产积极性，促进农林牧副渔各业生产的产品价格政策。
2．要搞好农用生产资料的生产和供应，加强价格管理，降低流通费用，使农民群众得到更多的实惠。
3．要调整国民收入分配格局，加大对农业的投入力度，保证各项投入及时足额到位。农业综合开发项目区投入增加后．常规农业各项投入不能减少，对此．各地必须严格执行。
4．要继续落实“八五”期间对农业综合开发实行的优惠政策，如新开垦的耕地5年内免征农业税，柴油、化肥、农药、农膜等农用生产资料给予优先安排的政策， “九五”期间要继续保留。
5．要在农业综合范围内，实行谁开发、谁利用、谁受益，在一定时期内使用权不变，可以继承，可以依法有偿转让，，
6．要建立竞争机制实行奖优罚劣，投资不搞“基数”法。
7．要对改造中低产田和开垦宜农荒地增产的粮棉油糖等农产品，5年内不增加合同定购量。
8．要鼓励科技人员参加农业综合开发，对贡献突出的科技人员要给予奖励。
9．要视情况对农业综合开发专项贷款给于一定贴息。
10．要将国家立项的农业综合开发项目投资纳入国家固定资产投资计划，相应增加国家固定资产投资规模。